Увеличивает риск кровотечений при сочетании с антиагрегантами нестероидными противовоспалительными средствами. Вероятность поражения почек увеличивается при одновременном приеме с аминогликозидами полимиксином В и "петлевыми" диуретиками. Лекарственные средства блокирующие канальцевую секрецию увеличивают плазменные концентрации Цефотаксима и замедляют его выведение. Фармацевтически несовместим с растворами других антибиотиков в одном шприце или капельнице.